Criaturas que han sufrido los efectos anómalos del accidente y habitan la Zona. Algunos mutantes pueden reconocerse aún en sus hermanos no mutados, mientras que otras criaturas han quedado irreconocibles. Independientemente de sus raíces todas las criaturas son hostiles a los seres humanos. Como resultado de las mutaciones, algunas de estas criaturas han adquirido habilidades específicas cómo ver durante la noche, utilizar su mente como si de un arma se tratara, etc.. Entre mutantes las hostilidades dependen de factores como el riesgo a estar débiles o ser la presa de otra criatura. Por lo general, los mutantes se mueven en grupos y son una amenaza real para cualquier stalker. Viven en sus hábitats, y sólo se moverán en búsqueda de comida o para escapar de nuevos campos de anomalías y emisiones.