A ver, comenzando por el Clear Sky. Toda la facción Clear Sky muere a causa de la gran emisión, por eso no aparece luego en SoC. De Scar no sabemos tampoco nada más, es de suponer que también muere. Strelok sobrevive, pero con graves secuelas. Ahí se enlaza con el principio del SoC. Eres un stalker que ha perdido la memoria y has recibido el encargo de buscar a Strelok. Cuando llegas al final del juego, descubres que Strelok eres tú, y tienes que decidir qué hacer, entre las varias opciones que encuentras según llegues al monolito, o no.